Thèmes de recherche

1. Structuration des populations et évolution du paludisme.

>> Programme MGANE : Adaptation Génétique de Plasmodium falciparum, l’agent de la malaria, à un nouvel environnement humain.

- Objectif : déterminer et comprendre l’évolution des régions du génome de P. falciparum qui ont été la cible d’une sélection positive récente en Amérique du Sud et qui ont donc joué un rôle dans l’adaptation à son nouvel environnement humain et vecteur.

- Cadre : ANR Santé Environnement–Santé travail n°2007 sest 012 01 (2007-2010) - Coordinateur : F. Prugnolle.

- Collaborateurs : B. Ollomo, E. Leroy (CIRMF, Gabon).

>> Programme Maladies Infectieuses Emergentes, 2009 : Diversité des Plasmodiums de Singes en Afrique Centrale et Risque d’Emergence.

- Objectif : caractériser au mieux les espèces plasmodiales circulant chez les singes en Afrique centrale et d’ouest pour évaluer par la suite le risque potentiel du transfert de ces espèces plasmodiales aux humains.

>> Programme EREMIBA : Environnement et ré-emergence de maladies infectieuses en bassin amazonien : risques sanitaires et évolution de pathogènes humains majeurs.

- Cadre : ANR n°05938 / ANR 05 sest 008-02 (2005-2008) - Coordinateur : JM Fotsing.

- Collaborateurs : E. Legrand (Institut Pasteur, Guyane) et B. Carme (Centre Hospitalier de Cayenne).

>> Par ailleurs, nous travaillons avec des collègues thailandais (T. Pumpaiboon, P. Harnyuttannakorn) sur la diversité et la structuration des populations de Plasmodium falciparum en zone de faible transmission.

>> Résultats : Nous venons de détecter une nouvelle espèce de Plasmodium dans la lignée des Hominids (PLOs Pathogens, 2009) ; et l'ensemble des travaux réalisés sur le paludisme ont été valorisé par la production de 7 articles dont 2 PNAS et 1 Plos Pathogens.

2. Les borrélies et leurs vecteurs, des tiques des genres Boophilus et Alectorobius.

- Collaborateurs : partenaires de l’IRD (J.F. Trape) et du Sénégal (G. Diatta).

- Cadre : 2 projets ANR successifs :
> de 2005 à 2008 - thématique : "déterminants environnementaux de la répartition et de l’incidence de la borréliose à tiques à Borrelia crocidurae en Afrique de l’Ouest et du Nord." - ANR Santé environnement–santé travail ANR n° 05 9 28 / ANR 05 sest 003-02 (2005-2008)  - Coordinateur : J.F. Trape.
> depuis 2009 - thématique : "Diagnostic et épidémiologie moléculaires des infections à Borrelia crocidurae." - ANR Maladies infectieuses et leur Environnement n°ANR-08-MIEN-004-02 (2009-2012) - Coordinateur : J.F. Trape.

>> Résultats : Ces travaux ont conduit à la publication de 5 articles dont 1 Lancet.

3. En tant que collaborateur :

> Sur la toxoplasmose par l'analyse de la diversité et divergence génétique de souches de Toxoplasma gondii du Gabon et de France, en collaboration avec les équipes de MF Cesbron et M.L. Dardé de Grenoble et de Limoges.

> Sur la caractérisation génétique de nouvelles espèces vectrices de la fasciolose en Colombie, programme développé par Sylvie Hurtrez au GEMI.

> Sur la variabilité génétique du sorgho au Burkina faso, en collaboration avec P. Chantereau et C. Barro du CIRAD de Montpellier.

Research

1. Populations structure and evolution of malaria.

>> MGANE program: Génétic Adaptation of Plasmodium falciparum, the malaria agent, to a new human environment.

- Aims : the main objective of this project is to understand the evolution of the regions of the genome of P. falciparum that have been the target of recent events of positive selection in South America and hence that may have played a role in the adaptation of the parasite to a new human and vector environment.

- With : F. Prugnolle, B. Ollomo and E. Leroy (CIRMF).

>> Emerging infectious diseases program, 2009 : diversity of Plasmodium infecting primates in Central Africa and risk of emergence.

- Aims : to characterise the diversity of Plasmodium infecting primates in West and Central Africa in order to evaluate the potentiel risk of Plasmodium species transfert to humans.

>> EREMIBA program : Environment and emerging infectious diseases in the Amason basin : sanitary risks and parasite evolution in humans.

- With J.M. Fotsing, E. Legrand and B. Carme.

>> We also work with collaborators from Thailand (T. Pumpaiboon, P. Harnyuttannakorn) on the diversity and population structure of Plasmodium falciparum in low transmission areas.

>> Results : We demonstrated the existence of a new species of Plasmodium infecting chimpanzees in Gabon (named P. gaboni), a close relative to the most virulent species in humans, P. falciparum.

2. Borreliosis and their vectors, Boophilus and Alectorobius ticks.

- Collaborators : J.F. Trape and G. Diatta.

- Project :
> from 2005 to 2008 : "Factors responsible for the distribution and incidence of borreliosis (borrelia crocidurae) in West and North Africa."
> since 2009 : "Diagnostic and molecular epidemiology of Borrelia crocidurae infections."

3. As a collaborator :

> Study of toxoplasmosis through analysis of the genetic and phylogenetic diversity of Toxoplasma gondii strains in Gabon and France - with M.F. Cesbron et M.L. Dardé.

> Genetic characterisation of new vector species of Fasciolosis in Colombia - with Sylvie Hurtrez (GEMI).

> Genetic variability of sorghum in Burkina faso - with P. Chantereau and C. Barro (CIRAD).

Publications majeures

- Benjamin OLLOMO*, Patrick DURAND*, Franck PRUGNOLLE, Emmanuel DOUZERY, Céline ARNATHAU, Dieudonné NKOGHE, Eric LEROY, François RENAUD, 2009 A New Malaria Agent in African Hominids. PLOs Pathogens, 5 (5): e1000446. (*B.O. and P.D.* contributed equally to this work).

- ANNAN Z., DURAND P., AYALA F.J., ARNATHAU C., AWONO-AMBENE P., SIMARD F., RAZAKANDRAINIBE F.G., KOELLA J.C., FONTENILLE D., RENAUD F. 2007. Population genetic structure of Plasmodium falciparum in the two main African vectors, Anopheles gambiae and Anopheles funestus. Proc Natl Acad Sci U S A., 104 (19): 7987–7992.

- Vial L., Diatta G., Tall A., Ba H., Bouganali H., Durand P., Sokhna C., Rogier C., Renaud F., Trape JF. 2006. Incidence of tick-borne relapsing fever in west Africa. Lancet, 368: 37-43.

- Razakandrainibe*, F.G., Durand*, P., Koella, J., De Meeus, T., Rousset, F., Ayala, F.J., Renaud, F. 2005.“Clonal” population structure of the malaria agent Plasmodium falciparum in high-infection regions. Proc Natl Acad Sci U S A., 102 (48) 17388-17393.(*F.G.R. and P.D.* contributed equally to this work).

Autres :

- Khadijetou Mint LEKWEIRY, Mohamed Ould ABDALLAHI, Hampate BA, Celine ARNATHAU, Patrick DURAND, Jean-Francois TRAPE and Ali Ould Mohamed SALEM. 2009. Malaria Journal Preliminary study of malaria incidence in Nouakchott, Mauritania. Malaria Journal 2009, 8: 92.

- CONSTANTIN DE MAGNY G., RENAUD F., DURAND P., GUEGAN J.-F. 2009. Health ecology : a new tool, the macroscope. Oxford University Press. Ed. F. Thomas, J.-F. Guégan, F. Renaud : 129-148.

- GARNIER S., P. DURAND, C. ARNATHAU, A. M. RISTERUCCI, R. ESPARZA-SALAS, E. CELLIER-HOLZEM and G. SORCI. 2009 New polymorphic microsatellite loci in the house sparrow, Passer domesticus. Molecular Ecology resources. 9 (3): 1063-1065

- Prugnolle F, Durand P, Jacob K, Razakandrainibe F, Arnathau C, Villarreal D, Rousset F, de Meeus T & Renaud F (2008) A comparison of Anopheles gambiae and Plasmodium falciparum genetic structure over space and time. Microbes and Infection. 10: 269-275

- GUEGAN J.-F., CONSTANTIN DE MAGNY G., DURAND P., RENAUD F., 2007. Ecologie de la santé : le macroscope, un nouvel outil ! Chapitre dans Ecologie et évolution des systèmes parasités. Ed. F. Thomas, J.-F. Guégan, F. Renaud: 301-344.

- Chevillon C., Koffi B.B., Barré N., Durand P., Arnathau C., de Meeûs T. 2007. Direct and indirect inferences on parasite mating and gene transmission patterns. Pangamy in the cattle tick Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Infection Genetic and Evolution, Mar; 7 (2): 298-304.

- DE meeus t., McCoy k.D. , PRUGNOLLE F., CHEVILLON C., DURAND P., HURTREZ-BOUSSES S. , RENAUD F. 2007 . Population genetics and molecular epidemiology or how to « débusquer la bête”. Infection Genetic and Evolution, Mar; 7 (2): 308-32.

- Caillaud D., Prugnolle F., Durand P., Théron A., De Meeus T. 2006. Host sex and parasite genetic diversity. Microbes and Infection, 8: 2477-2483.

- Vial L., Durand P., Arnathau C., Halos L., Trape J.-F., Renaud F.., 2006. Molecular divergences of the Ornithodoros sonrai soft tick species, a vector of human relapsing fever in West Africa. Microbes and Infection, 8 : 2605-2611.

- KOFFI B.B., De Meeus T., Barré N., Durand P., Arnathau C., Chevillon C. 2006. Founder effects, inbreeding and effective sizes in the Southern cattle tick: the effect of transmission dynamics and implications for pest management. Molecular Ecology, 15: 4603-4611.

- Prugnolle F., De Meeus T., Pointier J.P., Durand P., Rognon A. & Théron A. 2006. Geographical variations in infectivity and susceptibility in the host-parasite system Schistosoma mansoni / Biomphalaria glabrata: no evidence for local adaptation. Parasitology. 1-7.

- Koffi B.B., Risterucci AM., Joulia D., Durand P., Barré N., de Meeus T., Chevillon C. 2006. Characterization of polymorphic microsatellite loci within a young Boophilus microplus metapopulation. Molecular Ecology Notes, 6: 502-504.

- BOGREAU, H, RENAUD, F., BOUCHIBA, H., DURAND, P., ASSI, S-B., HENRY, M-C., GARNOTEL, E., PRADINES, B., FUSAI, T., WADE, B., ADEHOSSI, E., PAROLA, P., KAMIL, M., PUIJALON, O., ROGIER, C., 2006. Genetic diversity and structure of African Plasmodium falciparum populations in urban and rural areas. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 74 (6): 953-959

- Hurtrez-Boussès S., Pendino A., Barnabé C., Durand P., Rondelaud D., Durand C., Meunier C., Hurtrez J-E. & Renaud F 2005. Shell morphology and genetic diversity of two lymnaeid snails, vectors of fasciolosis. Canadian Journal of Zoology, 83, 1643-1648.

- LAMBRECHTS L., HALBERT, J., DURAND, P., GOUAGNA, L.C., KOELLA, J. 2005. Host genotype by parasite interactions underlying the resistance of anopheline mosquitoes to Plasmodium falciparum. Malaria Journal, 4:3.

- PRUGNOLLE, F., THERON, A., POINTIER, J.P., JABBOUR-ZAHAB, R., JARNE, P., DURAND, P., De MEEUS, T. 2005. Dispersal in a parasitic worm and its two hosts : consequence for local adaptation. Evolution, 59 (2), 2005, pp. 296–303

> Agent chargé de la mise en oeuvre des règles d’hygiène et sécurité (ACMO CNRS).

> Correspondant Formation Permanente CNRS.

> Correspondant Partenariat et Valorisation CNRS.

> Membre élu au Conseil du Laboratoire GEMI dans le collège des ITA.

> Participe à la maintenance des salles de biologie moléculaire et co-responsable de la gestion des stocks du GEMI.