Financement: PATHdb est un projet IRD SPIRALES 2007 F. Chevenet, C. Barnabé, R. Christen, F. Renaud

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L´étude des interactions hôtes/parasites ou des agents pathogènes conduit souvent à cultiver et isoler un grand nombre de souches de micro-organismes, caractérisées et analysées pour leur pouvoir pathogène puis conservés par cryoconservation. Les souches type sont déposées dans des collections internationales, mais la plupart des souches initiales demeure dans les laboratoires.

Le GEMI dispose d´une collection de plus 5000 isolats relatifs aux genres Leishmania, Trypanosoma et Plasmodium. Nous proposons le développement d´un ensemble d´outils informatiques permettant la gestion de ces isolats. Le projet PATHdb permet : 1) une synthèse/réorganisation de l´information disponible, 2) la préservation d´un patrimoine (GEMI ou autres modèles biologiques/laboratoires), 3) la visibilité nationale/internationale de la souchotèque, 4) l´accessibilité à la communauté scientifique. En particulier, permettre aux biologistes (recherche académique ou industrielle) de rechercher les souches possédant des particularités intéressantes, et de contacter les propriétaires institutionnels des micro-organismes sélectionnés en vue de les obtenir, 5) l´établissement de plates-formes de communication permettant l´ouverture de coopérations, en particulier avec les pays en voie de développement (hébergement de souches par exemple).